<< на главную
<< назад

Своевременная индикация возбудителей дает шанс на предотвращение вспышки

Новый подход к обнаружению вируса гепатита А

Исследователи из Канады предложили комбинированный метод быстрого обнаружения вируса гепатита А в пищевых продуктах. Результаты представлены в сентябрьском выпуске журнала Applied and Environmental Microbiology (X.C. Shan, P. Wolffs, M.W. Griffiths. Rapid and quantitative detection of hepatitis A virus from green onion and strawberry rinses by use of real-time reverse transcription-PCR).

Вирус гепатита А (HAV), имеющий повсеместное распространение, очень часто попадает в организм человека вместе с пищей. Источником заражения моллюсков, фруктов, овощей в большинстве случаев являются инфицированная вода, почва и вирусоносители – фасовщики пищевых продуктов. Обнаружение HAV в пище ранее было затруднено из-за присутствия ингибирующих субстанций и низкой концентрации вирусов.

В основу нового подхода к решению проблемы ученые положили комбинацию двух методов. Метод иммуномагнитного разделения (IMS) позволил обойти указанные выше затруднения, а одна из модификаций метода ПЦР-анализа – real-time reverse transcription PCR – обеспечил высокую чувствительность, специфичность, скорость анализа и возможность количественной оценки концентрации вируса в исследуемых образцах. В данной работе изучались смывы из земляники и зеленого лука, т.к. последние вспышки гепатита А в Канаде были вызваны именно этими продуктами.

Использованный методический прием повышал чувствительность анализа в 20 раз, а общее время тестирования занимало всего шесть часов. Это открывает перспективы для текущего надзора за HAV в сельскохозяйственной продукции и объектах окружающей среды

Интернет-журнал "Коммерческая биотехнология" по материалам EurekAlert.

ПЦР-анализ выявляет в почве возбудителей туляремии

Возбудитель туляремии Francisella tularensis принадлежит к группе возбудителей особо опасных инфекций.

В исследовании под руководством Susan M. Barns поиск микроорганизмов из рода Francisella в образцах воздуха почвы и воды в Хьюстоне (штат Техас, США) проводился с помощью ПЦР-амплификации ДНК с использованием 16S rРНК-праймеров. В одном образце воды и семи образцах почвы были обнаружены микроорганизмы из этого рода. Это первое сообщение по применению методов, основанных на анализе ДНК, для индикации туляремийных микробов.

Результаты секвенирования ДНК из двух образцов почвы на 99,9% совпали с ДНК выделенных ранее штаммов Francisella tularensis. Дополнительный анализ с использованием наборов праймеров дал аналогичные результаты и позволил сделать предположение, что обнаруженные в техасской почве микробы принадлежат к новым разновидностям Francisella tularensis.

Результаты этого исследования позволили провести переоценку знаний в понимании разнообразия и распространенности рода Francisella и обогатить эпидемиологов новой информацией. Применение современных методов обнаружения патогенных микроорганизмов может стать надежным средством обеспечения биологической безопасности и противодействия биотерроризму.

Интернет-журнал "Коммерческая биотехнология" по материалам Applied and Environmental Microbiology.

Новая система индикации неизвестных вирусов человека

Идентификация новых видов вирусов является ключевым моментом и конечной целью при изучении инфекционных заболеваний, но технически представляет собой очень сложный процесс. Группа исследователей из Швеции и Сингапура разработала систему для широкомасштабного молекулярного скрининга вирусов в клинических образцах. Эта система основана на деплеции ДНК хозяина, рандомизированной ПЦР-амплификации, широкомасштабном секвенировании и биоинформатике. Технология была использована для исследования объединенных образцов респираторного тракта человека.

Первые опыты позволили обнаружить семь видов вирусов без применения каких-либо специальных реагентов. Среди обнаруженных вирусов были не описанные ранее коронавирус и парвовирус. Парвовирус, временно названный бокавирусом человека, в ретроспективном клиническом исследовании был найден еще у 17 пациентов и признан причиной инфекций нижнего отдела респираторного тракта у детей.

Методика молекулярного вирусного скрининга позволяет обнаруживать вирусы неизвестных видов в единичных или объединенных пробах. Авторы считают, что их результаты положили начало систематическому применению этой методики для индикации вирусов человека

Интернет-журнал "Коммерческая биотехнология" по материалам PNAS.

Проверяйте консервы биочипами!

Исследователи из Вашингтона разработали новый метод, позволяющий проводить быстрое и одновременное обнаружение стафилококкового и ботулинического токсинов в продуктах питания. Результаты представлены в сентябрьском выпуске журнала Applied and Environmental Microbiology (Sapsford e.a., Biosensor detection of botulinum toxoid A and staphylococcal enterotoxin B in food).

Стафилококковый энтеротоксин В (SEB) и ботулинический токсин А (Bot A) вызывают пищевые отравления у людей и представляют собой опасность как потенциальные биологические агенты военного применения. В консервированные томаты, сахарную кукурузу, зеленые бобы, грибы и тунец были впрыснуты оба токсина, все консервы после этого были выдержаны в течение двух часов при комнатной температуре. Для обнаружения SEB и Bot A ученые применили биосенсорные чипы, разработанные в морской исследовательской лаборатории (Naval Research Laboratory). Это позволило им быстро и одновременно идентифицировать оба токсина в пищевом субстрате.

Возможность мультианалитического исследования комплексных образцов открывает перспективу для скрининга продуктов питания, воды и воздуха на предмет их естественного и умышленного заражения токсинами микробного происхождения.

Интернет-журнал "Коммерческая биотехнология" по материалам EurekAlert.

<< на главную
<< назад